Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TTPAP49638 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TTPAP49638 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TTPAP49638 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms