Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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