Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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VAX2Q9UIW0 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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VAX2Q9UIW0 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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VAX2Q9UIW0 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAX2Q9UIW0 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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