Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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