Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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