Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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