Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms