Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms