Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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PUM3Q15397 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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PUM3Q15397 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PUM3Q15397 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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