Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms