Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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