Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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ITGB3BPQ13352 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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ITGB3BPQ13352 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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ITGB3BPQ13352 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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ITGB3BPQ13352 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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ITGB3BPQ13352 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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