Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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