Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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