Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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