Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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LINC00587B1AMM8 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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LINC00587B1AMM8 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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LINC00587B1AMM8 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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LINC00587B1AMM8 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LINC00587B1AMM8 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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