Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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USP35Q9P2H5 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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USP35Q9P2H5 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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USP35Q9P2H5 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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USP35Q9P2H5 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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USP35Q9P2H5 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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