Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NRF1Q16656 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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