Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms