Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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