Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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