Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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