Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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