Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
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MKRN4PQ13434 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
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MKRN4PQ13434 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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