Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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CHAF1BQ13112 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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CHAF1BQ13112 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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CHAF1BQ13112 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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