Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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FOXC1Q12948 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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FOXC1Q12948 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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FOXC1Q12948 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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FOXC1Q12948 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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FOXC1Q12948 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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FOXC1Q12948 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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FOXC1Q12948 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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FOXC1Q12948 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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FOXC1Q12948 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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FOXC1Q12948 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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