Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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