Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPREP23469 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPREP23469 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPREP23469 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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