Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP29Q9HBJ7 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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