Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms