Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCBE1Q6UXH8 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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