Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms