Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms