Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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CDH18Q13634 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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