Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms