Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms