Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ACACAQ13085 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ACACAQ13085 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ACACAQ13085 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms