Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms