Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms