Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms