Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SALL4Q9UJQ4 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SALL4Q9UJQ4 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms