Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAX2Q9UIW0 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms