Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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SALL3Q9BXA9 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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