Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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