Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDK4Q16654 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms