Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms