Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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