Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHHQ15465 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHHQ15465 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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