Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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