Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PTPN13Q12923 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PTPN13Q12923 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPN13Q12923 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPN13Q12923 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN13Q12923 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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